《教育部 国务院学位委员会关于批准2009年全国优秀博士学位论文的决定》, 2009年分别有98篇、363篇博士论文分别获得全国优秀博士学位论文和全国优秀博士论文提名论文,其中中国科学院分别有20篇、29篇入选(大气所各有1篇入选)。
大气所入选的两篇,其中一篇是我室胡波博士(导师王明星研究员)的博士论文《中国紫外与光合有效辐射的联网观测机器时空分布特征研究》,被评为全国优秀博士论文提名论文。另一篇是我室朱江研究员指导的郑飞博士的论文,被评为全国优秀博士学位论文。